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高效厭氧反應器處理藥用廢水主要含有各種天然有機物，其主要成分有糖、有機酸、苷類、蒽素類、木質素、生物堿、但寧、單寧、蛋白質、淀粉及其水解物。高效厭氧反應器處理藥用廢水含有許多環狀化合物、雜環化合物、有機磷、有機氯、苯酚和不飽和脂肪化合物。這些物質的去除或轉化是藥物廢水COD重要的去除方法。藥用廢水的主要污染物是高濃度有機廢水的污染。對于制藥行業來說，廢水的水質和用水量因藥品生產過程中不同的藥品品種和生產工藝而有很大差異。另外，由于產品更換周期短，廢水的水質和用水量往往會隨著產品的更換而波動，這是非常不穩定的。制藥廢水的另一個特點是有機污染物濃度高，懸浮固體，特別是木質素的比例輕，有機質含量高，色度高，廢水具有良好的生化性，間歇性排放，廢水成分復雜，水質和水變化大。
我們常用高效厭氧反應器處理藥用廢水有三種處理技術：
1.生物處理技術
該技術是一般有機廢水處理系統的重要工藝之一。它是一種利用微生物、細菌代謝、氧化、分解和吸附廢水中可溶性有機物和一些不溶性有機物并將其轉化為無害穩定物質的技術，從而凈化水。在現代生物技術處理過程中，好氧生物氧化、兼氧生物降解和厭氧消化降解被廣泛應用。生物處理技術因其經濟可行性和無二次污染而越來越受歡迎|起重視。
⒉化學處理技術
化學處理技術是應用化學原理和化學作用將廢水中的污染物成分轉化為無害物質，使廢水得到凈化的方法，其單元操作過程有中和、沉淀、氧化還原、催化氧化和焚燒等。
3.物化處理技術
物理化學處理技術是指廢水中的污染物在處理過程中通過相轉移的變化而達到去除且的處理技術，常用單元操作有萃取、吸附、膜技術、離子交換等。
